北京市常务副市长吉林在成立仪式上指出，北京是一个能源和资源都十分缺乏的城市，绝大部分能源和资源都要靠兄弟省市的支持，从外省输入，但是最缺乏的还是水。“十二五”期间解决水的问题，是北京市政府维系城市运转的第一任务。解决水的问题，一方面是要节水，另外一方面要加强水的循环和利用，还有一个渠道就是要引水。吉林说，城市要发展，水的充足和安全干净的供应十分重要，所以我们在两个方向上进行着战略性的研究。一是深层次的研究水，看北京到底有多少水，能够用多少水，使用后对北京的地质结构会产生什么样的影响。另外一个战略性研究是海水淡化，如何进一步的降低成本，在进行充分论证和研究的情况下，可以适时向北京引入海水淡化，可以补充北京的工业用水、环境用水，所以围绕着水进行研究是非常必要的。

清华副校长陈吉宁说，环境产业研究院以“助力国家环境产业的发展和经济增长模式的转型，为环境产业的振兴提供战略指引、技术创新以及人才培养的支持”为宗旨，致力于中国环境产业政策研究、环境领域高新技术研发与应用以及环境产业高级人才的培养与开发。凭借清华大学在环境产业研究和人才培养教育方面的优势，环境产业研究院将成为中国领先的环境产业领域综合研究机构。

2011年，节能环保产业正式位列七大战略性新兴产业，肩负起推动经济增长方式转变、实现经济社会和谐发展的战略使命。胡锦涛总书记在庆祝清华大学建校100周年大会上发表重要讲话时强调，“要积极推动协同创新，通过体制机制创新和政策项目引导，鼓励高校同科研机构、企业开展深度合作，建立协同创新联盟，促进资源共享，联合开展重大科研项目攻关，在关键领域取得实质性成果，努力为建设创新型国家作出积极贡献”。

环境产业研究院的成立正是清华大学响应国家高等教育机构参与推动国家节能环保战略新兴产业的发展、加快科技成果转化与产业化、深入开展校企合作、建立协同创新机制、开展知识创新与人才培养机制创新、更好的服务于产业发展与中国经济社会发展需求的一个重要举措。